10/01/2019

Tecnologías del lenguaje aplicadas al campo biomédico

En el marco de la XXXV Conferencia Internacional de la SEPLN, hemos asistido a la jornada organizada por la Secretaría de Estado para el Avance Digital , dirigida a difundir las iniciativas puestas en marcha en el Plan de Impulso de las Tecnologías del Lenguaje en distintos sectores de actividad, mostrar resultados de estudios que se han llevado a cabo recientemente y resaltar la importancia de las campañas de procesamiento del lenguaje natural en el campo de la sanidad y la biomedicina.

Durante la jornada, pudimos ver los aspectos destacados del Plan TL ( Plan de impulso de las tecnologías del lenguaje): Seguimiento del Plan TL , Infraestructuras Lingüísticas y Anotación, así como los proyectos europeos de traducción automática.

También pudimos conocer los estudios que en el ámbito del Plan TL, se están realizando: Estrategias formativa, Corpus Viewer, sistemas conversacionales, viabilidad de una versión en español del sistema UMLS, datos reutilizables como recursos lingüísticos y las Campañas de evaluación sobre infraestructuras lingüísticas.

La segunda parte de la jornada verso sobre las campañas de evaluación en sanidad, como  motor de generación de recursos
lingüísticos en biomedicina y sanidad y la mesa redonda  sobre la experiencias, necesidades, impacto y visión de participantes en este ámbito. que modero Montserrat Marimon,de la Oficina Técnica del Plan TL – BSC y  con la participación de Pilar López Úbeda, del Grupo SINAI, de la Universidad de Jaén, Naiara Pérez, de Vicomtech , Fadi Hassan, de la Universitat Rovira i Virgili Jordi Porta, Real Academia Española - RAE


El Plan de Impulso de las Tecnologías del Lenguaje (Plan TL) tiene como objetivo fomentar el desarrollo del procesamiento del lenguaje natural, la traducción automática y los sistemas conversacionales en lengua española y lenguas cooficiales.




7/16/2019

DESIMS - Plataforma de gestión avanzada de la información clínica de las pacientes con cáncer de mama


Hoy recogemos la ultima reunión F2F del proyecto Europeo DESIREE - "Decision Support and Information Management System for Breast Cancer", realizada en el centro de investigación Vicomtech, líder del proyecto.

En estas últimas sesiones de trabajo, se han presentado los resultados de los diferentes ámbitos del proyecto, en el caso de Bilbomatica, el desarrollo software que hemos realizado, denominado DESIMS ( DESiree Information Management System , que permite la gestión avanzada de la información clínica de las pacientes con cáncer de mama.

Destacamos los aspectos, mas reseñables de la validación clínica realizada a DESIMS:

- El Sistema desarrollado es percibido como fácil de usar.
- El time-line de los principales eventos del proceso de la paciente, es muy valorado por todos los participantes.
- El tiempo medio por paciente y escenario es aceptable.
- Permite un funcionamiento fluido de las sesiones del comité funcional de mama.



Junto a esta última reunión del proyecto, se realizó un workshop  organizado por el Instituto Oncológico ONKOLOGIKOA y Vicomtech,  en Donostia. Donde se mostraron los últimos avances en cuanto a los sistemas de apoyo a la decisión clínica y Big Data para oncología.

Aquí podéis acceder a algunos fragmentos de las intervenciones




9:00 – 9:15  Workshop Introduction & DESIREE Project Presentation, Iván Macía, Project Coordinator, Vicomtech

Session 1 -  DESIREE Technology Highlights and Results
       
9:15 – 9:30  Advances in Medical Image Analysis and Machine Learning for Segmentation and Classification of Breast Tissue and Tumours, Bryan Scotney, Ulster University (UK)
9:30 – 9:45  Advances in NGS Analysis - GeneSystems Platform, Carla Castillo Di Giacinto, Sistemas Genómicos (Valencia)
9:45 – 10:00  Radiobiological modelling: assessment of radiation induced toxicities, Ilias Sachpazidis, Medical Innovation Technology (Greece)
10:00 – 10:15     DESIREE Clinical Decision Support: guideline-based, case-based and experience based DSS, visual analytics, Naiara Muro, Vicomtech
10:15 – 10:30    DESIREE Demo, Amaia Ugarriza, Bilbomática
10:30 – 11:00     Coffee Break    

Session 2  - Clinical and Patient Perspectives       
     
11:00 – 11:15     Complexity of Clinical Decisions in Breast Units: role of Decision Support Systems,  Brigitte Seroussi, INSERM / Assistance Publique Hopitaux Paris, France   
11:15 – 11:30     Validation of DSS Systems for Oncology. The DESIREE approach Sylvia Pelayo (INSERM, France)
11:30 – 11:45     Incorporation of the patient in the decisional process and use of PROMs, Ander Urrutikoetxea, Onkologikoa
11:45 – 12:00    Experiences in Health Outcomes Measurement of patients with cancer. Isabel Álvarez, Hospital Universitario Donostia / Biodonostia 
12:00 – 12:15     Open Discussion
12:15 – 12:30     Coffee Break    

Session 3 - Relevant Initiatives on Big Data and DSS for Oncology

12:30 – 12:45    Project NUBIA - Quantification of novel breast cancer biomarkers via pathology image analysis. María del Mar Vivanco (CIC-bioGune), Alba Garín-Muga (Vicomtech)
12:45 – 13:00   Project Big Medilytics – Improving Healthcare in Europe through Big Data, Alexandra Muñoz, INCLIVA (Valencia)
13:00 – 13:15   Project BD2DECIDE – Decision Support System for Head and Neck Cancer, Manuel Ottaviano (Universidad Politécnica de Madrid)
13:15 -13:30     Project NeverMind –  Tools for self-management and risk reduction of depressive symptoms in patients with severe somatic disease, Manuel Ottaviano (Universidad Politécnica de Madrid)
Project NeverMind – Mental Health Support in Cancer  Manuel Ottaviano (Universidad Politécnica de Madrid)
13:30 – 14:00    Multiscale model, Aesthetic outcomes prediction. Marc Garbey, Houston Methodist (USA)
14:00 – 14:15    Workshop conclusions, next steps & farewell, Iván Macía, Vicomtech
14:15     Lunch   


"El centro vasco VICOMTECH ha liderado el proyecto europeo Desiree, que ha permitido crear una plataforma informática que mejorará el procesamiento de información y ayudará a los profesionales médicos en el tratamiento de pacientes con cáncer de mama"

European UnioneHealth

Este proyecto ha recibido fondos de la Unión Europea en el marco del programa de investigación e innovación Horizon 2020 con el número de acuerdo de subvención 690238.

 Los autores quieren agradecer el conocimiento y las contribuciones de los miembros del consorcio.

This project has received funding from the European Union´s Horizon 2020 research and innovation programmme under grant agreement No 690238.

The authors wish to thank all consortium members the knowledge and
contributions.



6/24/2019

Carestar - Herramienta para el apoyo a médicos y pacientes en el tratamiento del trastorno bipolar

Hoy recogemos la Jornada "Transformación Digital de la Red de Salud Mental de Bizkaia",  organizada por GAIA y la Red de Salud Mental de Bizkaia-Osakidetza (RSMB), realizada para impulsar la transformación digital de Osakidetza (Red de Salud Mental de Bizkaia), aportando soluciones tecnológicas al sector sanitario.

Las temáticas que se trabajaron fueron la salud mental, la cronicidad, el envejecimiento y la innovación en la gestión.  

El objetivo fue realizar una toma de contacto entre el sector empresarial tecnológico y el sanitario. Permitiendo conocer los desarrollos existentes en la actualidad e identificando oportunidades para el desarrollo de proyectos conjuntos que se puedan aplicar para mejorar soluciones existentes e idear nuevas soluciones.

Bilbomatica participó en las mesas de trabajo de salud mental y en innovación en la gestión. presentando la solución Carestar "Herramienta para el apoyo a médicos y pacientes en el tratamiento del trastorno bipolar" 

La importancia de los trastornos mentales es evidente teniendo en cuenta la situación.

Afecta al 2-5% de la población, iniciándose entre los 20-30 años.

La morbilidad y mortalidad de los pacientes con enfermedades mentales es alta, con una esperanza de vida de casi 10 años inferior a la de la población general.

Carestar desarrolla un nuevo servicio basado en las TIC en salud mental. Utilizando de forma configurable datos subjetivos, módulos de aprendizajes, ejercicios y cuestionarios  y  datos objetivos, datos recogidos del móvil sobre la actividad y el uso, así como de movilidad (GPS).

 La herramienta se centra en el abordaje terapéutico a través de  programas de psicoestimulación y psicoterapia online, con objeto de aumentar la adherencia terapéutica de los pacientes con trastorno bipolar y monitorizar el estado de ánimo y la actividad de los mismos

El punto de partida fue el resultado de la aplicación, de un caso de uso dirigido a los trastornos bipolares desarrollada por IK4-TEKNIKER en el marco del proyecto FI-STAR en colaboración con Osakidetza. Posteriormente desarrollamos una solución de mayor alcance para el trastorno bipolar a través de un concurso Europeo de Compra Publica Pre-comercial (PCP), a través del proyecto NYMPHA-MD en Trento (Italia)

El uso Carestar es un útil complemento al tratamiento habitual, ayudando a los pacientes a controlar sus enfermedades y ayudando al proveedor de salud, especialmente a los profesionales de la salud, a través de la retroalimentación que reciben de los pacientes.

Aportando un mejorar de la calidad del servicio, la seguridad, la adherencia al tratamiento y la calidad de vida del paciente.

  • A los profesionales sanitarios, les dota de:

- Información en tiempo real
- Ayuda en la identificación temprana de las desviaciones en el estado de ánimo y las actitudes que sugieren el inicio de una crisis

  • A los pacientes, cuidadores informales y familia, les permite:

- Conocimiento sobre la enfermedad
- Poder gestionar la enfermedad

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Agradecemos a Patricia Casla de IK4-TEKINER, promotora de la solución Carestar,  su colaboración en la preparación de esta jornada.

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5/27/2019

DESIREE 360 - Breast Cancer Workshop - Jornadas Clínicas sobre el cáncer de mama - PARÍS


La comisión Europea se ha hecho eco del Workshop “DESIREE 360º - Breast Cancer” , Jornadas Clínicas sobre el cáncer de mama, organizado por el equipo francés del consorcio del Proyecto DESIREE, en representación de Assistance Publique - Hôpitaux de Paris(AP-HP) y del Instituto INSERM, a los que agradecemos cordialmente su acogida.

A lo largo de todo el evento, hubo un intensa interacción con los representantes de la industria farmacéutica de Roche, Novartis, MSD, Astrazeneca y Lilly Laboratory.

Se debatieron aspectos del sistema, como la incorporación de las guías clínicas, el manejo de los datos de los pacientes, la interoperabilidad y universalidad de la plataforma.
Asi mismo proporcionaron información valiosa sobre la plataforma y las oportunidades de explotación, destacando los puntos fuertes (p. ej., facilidad de uso, coherencia, datos del mundo real para el análisis) y los retos (p. ej., complejidad de la implementación práctica, aceptación y compromiso del médico).

Dr. IvanMacia (Vicomtech), Coordinador del Proyecto DESIREE, realizo una presentación del Proyecto.

Dr. Luis Teixeira, M.D,Ph.D.  (Saint Louis Hospital) ,  Amaia Ugarriza Pinedo  (Bilbomática S.A.),  Jon Belloso Linacisoro (Oncologikoa) presentaron DESIMS “Plataforma software de gestión de comités multifuncionales con ayuda a la toma de decisión” y Stefan Audersch (Arivis AG) mostró las capacidades en el ámbito de imagen avanzada.



European UnioneHealth

Este proyecto ha recibido fondos de la Unión Europea en el marco del programa de investigación e innovación Horizon 2020 con el número de acuerdo de subvención 690238.

 Los autores quieren agradecer el conocimiento y las contribuciones de los miembros del consorcio.

This project has received funding from the European Union´s Horizon 2020 research and innovation programmme under grant agreement No 690238.

The authors wish to thank all consortium members the knowledge and
contributions.

3/11/2019

Jornadas Clínicas sobre el cáncer de mama en el proyecto DESIREE "Decision Support and Information Management System for Breast Cancer"


Hoy recogemos las Jornadas que se van a realizar en marzo en el marco del proyecto DESIREE "Decision Support and Information Management System for Breast Cancer" en la reunión plenaria organizada por Assistance Publique - Hôpitaux de Paris. En el Hôpital Saint-Louis.

Durante estas jornadas se continuará con la fase de validación de la plataforma y con el objeto de dar a conocer los resultados del proyecto y compartir las experiencias en el ámbito del cáncer de mama, participaran:

Nora Benhabiles PhD,  EMBA,  Director of the Industrial Partnerships and External Collaborations of the Fundamental Research Division in CEA (French Atomic Energy Agency), Member of the supervisory board of EIT Health representing the French EIT Health academics and member of the board of CEA Investment funds). 


Presentará el proyecto ITFoC "will establish a standardised and well-validated approach for virtual patient modelling in oncology, through comparative analysis of computational model approaches for predicting patient response to treatment based on molecular data (e.g. exome/transcriptome/metabolome) from individual patients and tumours. Existing and newly generated large scale molecular and clinical datasets on (triple negative) breast cancer patients from across Europe, as well as ongoing data standard initiatives, will be leveraged to provide standardised and validated datasets, accessible via a common database."
Julien Guérin  Institut Curie, Paris with expertise in Information Science, Information Systems (Business Informatics)

Dr Alain Livartowski Doctor in the Department of Oncology - Institut Curie and a member of the Thorax Institute.

Desde el Instituto Marie Curie de París Julien Guérin y Dr. Alain Livartowski presentaran la experiencia en Inteligencia artificial (AI) , Big Data y Apoyo en la toma de decisiones (CDS).

"Big data et intelligence artificielle : une révolution annoncée" Dans le domaine de l’aide au diagnostic et de la prédiction de la réponse au traitement, ou afin de mieux déterminer le risque de récidive, il s’agit d’utiliser les technologies de machine learning*, et du deep learning* pour l’analyse automatique des dossiers médicaux, des images et des données génomiques notamment.

Ces nouvelles approches soulèvent d’emblée des questions : sommes-nous capables d’extraire des données exploitables pour faire progresser nos connaissances ? Préalablement à cette exploitation, de nombreux problèmes doivent être résolus : d’ordre juridique comme l’accès aux données, les problèmes de confidentialité et de consentement du patient ; d’ordre technique comme la qualité des données sources, leur interopérabilité et leur intégration. Se poseront ensuite les questions de l’évaluation de ces aides à la décision et de leur appropriation par le monde médical.

Les grands centres hospitaliers à travers le monde ont un rôle majeur à jouer dans cette transformation car ils concentrent les bases de données les plus riches et les plus proches de la réalité clinique. C’est le cas à l’Institut Curie, riche de 500 000 dossiers patients et pionnier dans l’informatisation des données cliniques. Pour faire face aux besoins de nouvelles compétences et technologies de pointe, une direction des data a été créée en 2017 avec une mission claire: la gestion de notre transformation numérique."...

Dr Serge Uzan Directeur de l’Institut Universitaire de Cancérologie, Conseiller du Président de Sorbonne Université

Expondrá los trabajos realizados en el ámbito "Risk management platform in oncology"

Professor Serge Uzan, director of the University Institute of Oncology, talks about the successes of this multidisciplinary structure that brings together the research, care and training in the fight against cancer. The University Institute of Oncology (IUC) was created in 2012 to bring together the care, research and teaching forces dedicated to oncology at Sorbonne University. We have several hospital care sites, including La Pitié-Salpêtrière, Charles Foix, Saint-Antoine, Tenon, Rothschild, and Trousseau, as well as many research units devoted to work related to cancer
Suzette DELALOGE, MD MSc, is Associate Professor of Medical Oncology and Head of Breast Cancer Department at Gustave Roussy Institute, Paris, France.

Presentara el proyecto "Personalising Breast cancer Screening, MyPeBS project

MyPeBS (My Personal Breast Screening) is a unique international project, funded by the European Union. It investigates whether a personalised breast cancer screening could be a better screening option for women aged 40 to 70.

MyPeBS is a European research project that aims to assess the effectiveness and feasibility of personalised breast cancer screening, one that is based on the personal risk of developing breast cancer for each individual woman.
To meet such a goal, at MyPeBS’s core is a multi-centre, international, randomised clinical study that will recruit 85,000 women from Belgium, France, Israel, Italy and the United Kingdom.
This study will compare the current standard breast screening with a personalised strategy, which screens women at higher risk of breast cancer more often, and women at a lower risk of breast cancer less often.
The goal of this study is to answer a simple, yet fundamental, question: is it better to personalise the method and frequency of breast screening based on a woman’s individual risk?

MyPeBS is coordinated by Unicancer, a large non-for profit French national federation of hospitals dedicated to oncology and a major European academic sponsor in oncology. The project overall is supervised and controlled by an Executive Committee comprised of key actors of the project, and any decision affecting the governance, composition or financing of the Consortium is taken by a General assembly where each partner is represented.
Nicole Zernikprésidente d'Europa Donna France.  Coalition européenne contre le cancer du sein

Poniendo la voz a las pacientes de cáncer de mama, compartirá la experiencia "Breast Cancer Management from the eyes of patients" 




European UnioneHealth

Este proyecto ha recibido fondos de la Unión Europea en el marco del programa de investigación e innovación Horizon 2020 con el número de acuerdo de subvención 690238.

 Los autores quieren agradecer el conocimiento y las contribuciones de los miembros del consorcio.

This project has received funding from the European Union´s Horizon 2020 research and innovation programmme under grant agreement No 690238.

The authors wish to thank all consortium members the knowledge and
contributions.

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