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31 enero 2024

LUCIA: Factores de riesgo relacionados con el cáncer de pulmón y su evaluación del impacto.


Nos encontramos trabajando en el marco del Proyecto LUCIA – LUng Cancer-related risk factors and their Impact Assessment en la Implementación de Keycloak y OMOP para seguridad y datos Estandarizados en Cáncer de Pulmón. 

Consideramos que en el mundo de la salud y la investigación médica, la seguridad de los datos y la estandarización son cruciales.

Keycloak es una herramienta de gestión de identidad y acceso (IAM) que nos proporciona:

- Autenticación centralizada: Permite a los usuarios autenticarse una sola vez y acceder a múltiples aplicaciones sin necesidad de volver a ingresar sus credenciales.

- Autorización basada en roles: Define roles y permisos para controlar el acceso a recursos y funcionalidades dentro de una aplicación.

- Integración con sistemas existentes: Keycloak se integra fácilmente con aplicaciones web, servicios REST, bases de datos y otros sistemas.

- Seguridad de red: Proporciona una capa adicional de seguridad al proteger las comunicaciones entre aplicaciones y usuarios.

- Administración de usuarios y grupos: Permite gestionar usuarios, grupos y sus atributos de manera centralizada.

El Modelo de Datos Común (OMOP CDM) es un estándar ampliamente utilizado en la investigación médica. Proporciona una estructura coherente para almacenar datos clínicos y de salud, lo que facilita el análisis y la comparación entre diferentes estudios. Sin embargo, como cualquier enfoque, también presenta ciertos riesgos y limitaciones en el contexto del cáncer de pulmón. A continuación, detallamos algunos de estos riesgos a los que nos enfrentamos:

- Limitaciones en la representación de datos específicos del cáncer de pulmón:

OMOP está diseñado para ser genérico y aplicable a una amplia variedad de condiciones médicas. Esto puede resultar en una falta de detalles específicos para el cáncer de pulmón, como marcadores moleculares, subtipos histológicos o características específicas de los pacientes con esta enfermedad.

- Complejidad en la adaptación de encuestas y cuestionarios:

No proporciona una estructura específica para encuestas o cuestionarios relacionados con el estilo de vida o factores de riesgo específicos del cáncer de pulmón. Adaptar estas herramientas a la estructura de OMOP puede ser complicado y requerir ajustes significativos.

- Falta de datos sobre exposiciones ambientales y hábitos de vida:

Se centra principalmente en datos clínicos y de atención médica. No incluye información detallada sobre exposiciones ambientales como la contaminación del aire o hábitos de vida en el tiempo como la actividad física o la dieta.

- Desafíos en la captura de datos longitudinales:

OMOP se basa en datos transaccionales, lo que significa que los eventos se registran en momentos específicos (por ejemplo, visitas al médico). Capturar datos longitudinales a lo largo del tiempo (por ejemplo, cambios en el estilo de vida , puede ser complicado dentro de la estructura de OMOP.

- Limitaciones en la representación de tratamientos específicos:

No siempre captura detalles específicos sobre tratamientos para el cáncer de pulmón, como terapias dirigidas o inmunoterapia. Esto puede dificultar el análisis de la efectividad de tratamientos específicos.

Aunque OMOP ofrece una estructura estandarizada para datos médicos, es importante considerar sus limitaciones y adaptarlo cuidadosamente al contexto del cáncer de pulmón


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El proyecto LUCIA recibe financiación del programa de investigación e innovación Horizon Europe de la Unión Europea en virtud del acuerdo de subvención  101096473.

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Se comparte en el marco de las actividades de difusión del proyecto / This post is shared within the scope of project dissemination activities.
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10 mayo 2023

LUCIA - Software para la comprensión de los factores de riesgo relacionados con el cáncer de pulmón - HORIZON

 

La cartografía de los factores de riesgo del cáncer de pulmón es un desafío complejo que requiere una gran cantidad de datos y una comprensión profunda de los factores biológicos, ambientales y sociales que influyen en la enfermedad.  

El uso del estándar OMOP ayudará a abordar estos desafíos al permitir que los investigadores compartan datos y conocimientos de manera más eficiente. Además, OMOP es compatible con una amplia variedad de fuentes de datos, lo que permite a los investigadores integrar datos de diferentes disciplinas para obtener una comprensión más completa de los factores de riesgo del cáncer de pulmón.

Bilbomática junto a sus socios, está trabajando en el desarrollo de una plataforma de software denominada Ecosistema de Software LUCIA  para permitir la integración, agregación y explotación de datos heterogéneos de cáncer de pulmón procedentes de cohortes y Historia clínica electrónica, fuentes de datos epidemiológicos y geoespaciales ambientales. El proyecto LUCIA se analiza y construye con un diseño basado en principios de seguridad, privacidad, ética y un plan de gestión de datos.

Es importante señalar que casi el 20% de los pacientes con cáncer de pulmón  son "no fumadores" o "nunca han fumado".  Aparte del tabaquismo, existen varios factores de riesgo y determinantes para el desarrollo, que pueden ayudar a comprender su evolución: Aumento de la edad, la mayoría de las personas tienen 65 años o más. Contaminantes interiores y exteriores, por ejemplo, radón, amianto, berilio, arsénico, sílice, compuestos de níquel, compuestos de cromo.  Las condiciones de salud, antecedentes familiares, enfermedades pulmonares, cánceres de cabeza y cuello y de esófago. La expresión Genética es responsable del 8% de los casos.  Diferencias en las vías biológicas, aunque los mecanismos a través de los cuales el tabaquismo contribuye a la formación y progresión están relativamente claros, las vías biológicas a través de las cuales contribuyen otros factores de riesgo están menos claras.

Por estas razones, existe una necesidad urgente de establecer herramientas de evaluación de los factores de riesgo para el cáncer de pulmón y sus subcategorías, incluidas las formas menos frecuentes , para comprender mejor la enfermedad. Esto permitiría orientar mejor políticas de salud pública hacia vías de diagnóstico más eficaces. 




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El proyecto LUCIA recibe financiación del programa de investigación e innovación Horizon Europe de la Unión Europea en virtud del acuerdo de subvención  101096473.

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20 febrero 2023

LUCIA - Comprensión de los factores de riesgo relacionados con el cáncer de pulmón y su impacto - HORIZON



"Las oportunidades no pasan, las creas"
por ello fruto del trabajo constante, Bilbomática ha conseguido un nuevo proyecto en el ámbito del cáncer de Pulmón. LUCIA (Understanding Lung Cancer-Related Risk Factors and their Impact) correspondiente a la convocatoria Horizon Europe Framework Programme (HORIZON) que ha obtenido financiación en la convocatoria Research and Innovation actions supporting the implementation of the Mission on Cancer 2022. Esta convocatoria apoya colaboraciones internacionales que aporten soluciones tecnológicas prácticas a los retos actuales. LUCIA cuenta con 22 miembros.



El proyecto cuenta con la participación de nueve países europeos que tiene por finalidad la gestión del cáncer de pulmón desde el punto de vista diagnóstico precoz, la prevención y el tratamiento, sobre todo de los cánceres de pulmón relativamente raros. Los resultados del trabajo del consorcio se traducirán en recomendaciones, que se integraran en el programa de diagnóstico precoz y en métodos para abordar la enfermedad de forma eficaz.

El objetivo del consorcio es cartografiar los factores de riesgo del cáncer de pulmón centrándose en tres aspectos:

- Factores de riesgo individuales, incluidos el estilo de vida y la exposición a contaminantes,
- Factores externos, como las zonas urbanas o urbanizadas, el tráfico, el clima y los aspectos socioeconómicos
- Respuestas biológicas, como el envejecimiento y los cambios genéticos, epigenéticos y metabólicos

El Proyecto es liderado por TECHNION (Israel Institute of Technology) y entre los participantes contamos con las siguientes organizaciones sanitarias: el Servicio Vasco de Salud Osakidetza (BioCruces), Federation Europeenne des Hôpitaux et des Soins de Sante , Centre Hospitalier Universitaire de Liège y el Servicio Andaluz de Salud- SAS 

Queremos aprovechar a agradecer a Vicomtech y a Technion - Instituto Tecnológico de Israel, por haber contado con Bilbomática a la hora de la creación del consorcio del proyecto.







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El proyecto LUCIA recibe financiación del programa de investigación e innovación Horizon Europe de la Unión Europea en virtud del acuerdo de subvención  101096473.

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