2/19/2018

No hay mejor andar que no parar, HADOOP 3.0

Aprovechando la jornada de trabajo con Felipe Haynes y Raú Marín de Hortonworks y  David Olmos y Gustavo Fernández de Zylk. Os dejamos un pequeño articulo sobre la nueva versión de Hadoop 3.0 .
Recordar que Zylk y Hortonworks realizan el próximo 15 de marzo en el Hotel NH Collection Villa de Bilbao un evento con conferencias, networking y casos de éxito de la utilización del Big Data 




Principales diferencias entre  HADOOP 2.0 y 3.0 :

CARACTERÍSTICA
HADOOP 2.x
HADOOP 3.x
Versión Java mínima soportada
java 7
java 8
Esquema de almacenamiento
Usa un esquema de replica que multiplica x3 el espacio de almacenamiento.
Soporta erasure coding(1) en HDFS reduciendo el espacio de almacenamiento.
Tolerancia a fallos
Puede manejarse mediante la replicación (que es un desperdicio de espacio).
Puede manejarse mediante erasure coding ofreciendo el mismo nivel de tolerancia a fallos pero con una considerable reducción de espacio de almacenamiento.
Storage Overhead
(Sobrecarga del espacio de almacenamiento)
HDFS tiene una sobrecarga del 200% en el espacio de almacenamiento, ya que hace copias al 100% de los datos (el factor de réplica mínimo y por defecto en Hadoop 2 es de 3) los cuáles, en la mayoría de las ocasiones, no son usados . Por ejemplo: Si hay 6 bloques, habrá 18 bloques ocupados debido al esquema de replicación.
Con el  erasure coding   en Hadoop 3, si hay 6 bloques de datos, ocupará un espacio de 9 bloques - 6 bloques de datos y 3 para la paridad - lo que conlleva una menor sobrecarga de almacenamiento. El resultado final: en lugar de necesitar multiplicar por 3 el almacenamiento, el método de almacenamiento de erasure coding tendrá una sobrecarga de 1.5x, manteniendo el mismo nivel de recuperación de datos. Reduce a la mitad el costo de almacenamiento de HDFS a la vez que conserva la durabilidad de los datos. La sobrecarga de almacenamiento se puede reducir de 200% a 50%. Además, se beneficia de un ahorro de costes en infraestructuras.
YARN Timeline Service
Utiliza un viejo timeline service que tiene problemas de escalabilidad.
Mejora el timeline service v2 y mejora la escalabilidad y la confiabilidad del mismo.
Rango de puertos por defecto
En Hadoop 2.0, algunos puertos predeterminados son del rango de puertos efímeros(2) de Linux (32768-61000). Por lo tanto, en el momento de la puesta en marcha, pueden  fallar al conectarse al entrar en conflicto con otras aplicaciones.
En Hadoop 3.0 estos puertos se han movido fuera del rango efímero.
Sistemas de ficheros compatibles
  • HDFS (Sistema de ficheros por defecto)
  • Sistema de archivos FTP: almacena todos sus datos en servidores FTP accesibles remotamente
  • Sistema de archivos Amazon S3 (Simple Storage Service)
  • Sistema de archivos Windows Azure Storage Blobs (WASB).
Es compatible con todos los anteriores, así como con el sistema de archivos Microsoft Azure Data Lake y Aliyun Object Storage System .
Escalabilidad
  • Podemos escalar hasta 10,000 nodos por clúster.
  • Hadoop 2 y Hadoop 1 solo usan un único NameNode para administrar todos los Namespaces.
  • En Hadoop 2 hay  solamente un NameNode en standby
  • Se pueden escalar más de 10.000 nodos por cluster.
  • Hadoop 3 tiene múltiples Namenodes para múltiples Namespaces debido al uso de  NameNode Federation que mejora la escalabilidad.
  • Hadoop 3 soporta múltiples NameNodes en stanby.
Nuevos casos de uso
Hadoop 2 no soporta GPUs (Graphics Processing Unit)
Hadoop 3 permite la programación de recursos adicionales, tales como discos y tarjetas gráficas para una mejor integración. Por ejemplo, el administrador del clúster podría definir recursos como GPU, licencias de software o almacenamiento conectado localmente. Las tareas de YARN se pueden programar según la disponibilidad de estos recursos. Esta característica proporciona la base para admitir GPU en clústeres de Hadoop, lo que mejora un rendimiento de los cálculos necesarios para los casos de uso de Ciencia de datos e Inteligencia Artificial.
Nuevos componentes
El uso de Erasure Coding incluye nuevos componentes en la arquitectura:

  • Namenode Extension (ECManager): reside en el Namenode y coordina toda la tarea de codificación y decodificación.

  • Client Extension (ECClient):es la extensión del cliente HDFS que notifica al ECManager los bloques que faltan y lee los datos reconstruidos por el ECWorker.

  • Datanode Extension (ECWorker): ubicados en los Datanode. Cada vez que se decodifica o codifica un bloque, el ECWorker del Datanode lleva a cabo su cálculo siguiendo las instrucciones enviadas por el ECManager quién le suministra el esquema de codificación.

(1) La funcionalidad HDFS Erasure Coding usa RAID (Redundant Array of Inexpensive Disks). RAID implementa EC utilizando stripping, es decir, almacena los ficheros de manera lógica en forma de bloque (unidad pequeña) y almacena cada bloque en discos diferente. Para cada bloque (celda) se calculará y almacenará la paridad. Esto se llama codificación. Se almacena 1 bloque de paridad por cada 2 bloques de datos. Lo que implica tener un 50% de sobrecarga del espacio de almacenamiento frente al 200% que supone el antiguo replicado con factor 3 del 100% de los datos en Hadoop 2.

(2) Los puertos efímeros son puertos temporales asignados por la pila de IP de una máquina y se asignan dentro de un rango designado de puertos para este propósito. Cuando la conexión finaliza, el puerto efímero está disponible para su reutilización, aunque la mayoría de las pilas IP no reutilizarán ese número de puerto hasta que se haya utilizado todo el conjunto de puertos efímeros. Por lo tanto, si el programa cliente se vuelve a conectar, se le asignará un número de puerto efímero diferente para su lado de la nueva conexión.)


Para más información se puede consultar:


·        How Apache Hadoop 3 Adds Value Over Apache Hadoop 2

·        Apache Hadoop 3.0.0

·        Comparison Between Hadoop 2.x vs Hadoop 3.x 1

·        What’s New in Hadoop 3.0 – Enhancements in Apache Hadoop 3

·        What's new in hadoop 3.0

·        Getting to Know Hadoop 3.0 -Features and Enhancements. Why Hadoop 3.0? What’s New in Hadoop 3.0? Difference between Hadoop 2.x vs. Hadoop 3.x

·        Hadoop 3.0 - Revolution or evolution?



2/15/2018

Formatos de contenido móvil - Accelerated Mobile Pages (AMP) * Actualizada *

Quizás navegando desde el móvil, os hayáis fijado, que en ciertos resultados de Google , aparecen con un pequeño logo de un rayo y las siglas AMP (Accelerated Mobile Pages) .

Pues estas siglas, corresponden a una iniciativa de software libre que surge de los debates entre editores y empresas tecnológicas sobre la necesidad de mejorar el ecosistema de contenido móvil en su conjunto para los editores, plataformas de consumidores, creadores y usuarios.

Según Google, aquellas webs que implementen sus páginas bajo el esquema y las especificaciones de AMP funcionarán en cualquier navegador o aplicación que permita la visualización web, con la ventaja de que las páginas cargarán cuatro veces más rápido y usarán diez veces menos datos que la misma página sin la implementación de Google AMP. La contrapartida es cómo afecta este formato a los anuncios/publicidad servidos en esas páginas.

Hoy en día, se espera que el contenido de las páginas web se cargue muy rápido y que la navegación sea sencilla. En realidad, sin embargo, el contenido puede tardar varios segundos en cargarse o puede no llegar a cargarse completamente porque los usuarios abandonan las páginas lentas. Las páginas Accelerated Mobile Pages son páginas web diseñadas para cargarse casi instantáneamente, en un paso más hacia una Web móvil mejor para todo el mundo.

Si tenemos en cuenta que en Octubre del 2016, la navegación movil&Tablet supero a la de versiones de escritorio, estamos en el punto de inflexión del consumo de internet

AMP tiene sentido cuando tienes una web en la que publicas contenidos o noticias, un blog corporativo…. Todo lo que mejore la velocidad de carga, optimice el  site y mejore la experiencia del usuario es bueno para tu web y Google te premiara con una mejora de posicionamiento web.

A continuación os dejamos información  sobre la implementación de AMP en Drupal:

AMPing up Drupal

"Posted by Matthew Tift, Lullabot
This post originally appeared at https://www.lullabot.com/articles/amping-up-drupal

Today we are proud to announce a new Drupal 8 module that provides support for the Accelerated Mobile Pages (AMP) Project. The AMP Project is a new open source initiative which drastically improves the performance of the mobile web. In January 2016 Lullabot and Google started working together to create the Drupal AMP module. A beta version of AMP module for Drupal 8 is available immediately, and we are starting work on a Drupal 7 version of the module that will be available in mid-March...."

Drupal Accelerated Mobile Pages (AMP)

"Posted by moshe weitzman on 7 October 2015

The AMP module is designed to convert Drupal pages into pages that comply with the AMP standard. Initially only node pages will be converted. Other kinds of pages will be enabled at a later time.

When the AMP module is installed, AMP can be enabled for any node type. At that point, AMP content becomes available on URLs such as node/1?amp or node/article-title?amp. There are also special AMP formatters for text, image, and video fields.

The AMP Theme is designed to produce the very specific markup that the AMP HTML standard requires. The AMP theme is triggered for any node delivered on an ?amp path. As with any Drupal theme, the AMP theme can be extended using a subtheme, allowing publishers as much flexibility as they need to customize how AMP pages are displayed. This also makes it possible to do things like place AMP ad blocks on the AMP page using Drupal's block system...."

Google AMP: How and When should you implement Accelerated Mobile Pages?

"Speaker:
Joshua Stewardson

Google launched Accelerated Mobile Pages in April. We were early beta partners in implementing it and have tried out a few different implementation patterns with varying degress of success.

We will cover the history of AMP and when you should start caring about it (for some sites that might have been in April, for others it might not be for another year or two). Then we will go over the how with options for implementation (contrib module, custom theme, third-party service, etc.)."

The implementation of AMP standard for Drupal 8

You’ll probably agree that mobile devices are becoming more and more significant, as they bring convenience in our lives. Drupal 8 has many mobile improvements, and today we’ll focus your attention on one of them — AMP standard. By the way, this is a technical blog post that was written by our Drudesk developer, along with our previous dev’s post about checking and improving your Drupal website’s security.

AMP (Accelerated Mobile Pages) is a standard designed to speed up web page loading on mobile devices. It consists of the following three parts:

   - AMP HTML — HTML with the limitations and additions
   - AMP JS — high-performance visualization tool
   - Google AMP Cache — service for the processing of cached web pages

AMP standard is implemented by creating additional AMP versions of pages, which will be loaded when viewing from a mobile device. Nowadays there are tools for AMP standard integration for Drupal sites.

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Actualizado:

XatakaGoogle, de verdad, AMP no mola (tampoco en el correo electrónico)

"La empresa que controla nuestras vidas búsquedas vuelve a la carga. Tras intentar primero que AMP triunfase como sustituta de las páginas web HTML de toda la vida, ahora quieren que esa plataforma conquiste nuestro correo electrónico.

El anuncio de esa nueva variante de la tecnología plantea sobre el papel ventajas interesantes, pero lo que no nos dice, como tampoco hizo AMP en sitios web, es lo que obtendrá Google con ella: atrapar al usuario para que nunca salga de su motor de búsqueda, de sus páginas web AMP o, ya puestos, de Gmail. "...

...

"En TechCrunch lo expresaban a la perfección: "AMP es una forma de adaptar y ofrecer, bajo las reglas de Google, páginas web reales desarrolladas con herramientas reales". En Google de nuevo plantean otra amenaza para hacer que algo que no controlaban (no al menos totalmente) y que era estático se convierta en algo bajo control y dinámico. Dinámico para qué, os preguntaréis. Fácil de nuevo: publicidad.

El correo electrónico ya funciona fantásticamente, de verdad. Déjenlo tranquilito, señores de Google."

Techcrunch: AMP for email is a terrible idea

"Google just announced a plan to “modernize” email with its Accelerated Mobile Pages platform, allowing “engaging, interactive, and actionable email experiences.” Does that sound like a terrible idea to anyone else? It sure sounds like a terrible idea to me, and not only that, but an idea borne out of competitive pressure and existing leverage rather than user needs. Not good, Google. Send to trash.

See, email belongs to a special class. Nobody really likes it, but it’s the way nobody really likes sidewalks, or electrical outlets, or forks. It not that there’s something wrong with them. It’s that they’re mature, useful items that do exactly what they need to do. They’ve transcended the world of likes and dislikes."
...

"What is the vast majority of “live” content on the web, stuff that needs to call home and update itself? Not articles like this one, or videos or songs — those are just resources you request. Not chats or emails. Cloud-based productivity tools like shared documents, sure, granted. But the rest — and we’re talking like 99.9 percent here — is ads.

Ads and trackers that adapt themselves to the content around them, the data they know about the viewer, and the latest pricing or promotions. That’s how Google wants to “modernize” your inbox.

Does “engaging, interactive, and actionable email experiences” ring a little different now?

Don’t use this. Don’t encourage it. AMP and other initiatives like it are already a blight on the web, and they will be equally bad for email."

2/05/2018

Cuando llegas a la jubilación 1980-2018. Visión de las tecnologías de la información


Cuando en 1979 se lanza el Intel 8088, que dos años mas adelante se incluiría en el primer ordenador personal de IBM, nadie podía imaginar la velocidad tan vertiginosa en la que evolucionarían los ordenadores, hasta contar en la actualidad con equipos con procesadores Intel Xeon de 18 nucleos.

Este lapso de tiempo, es el que Luis Álvarez Director de Operaciones de Bilbomática, ha dedicado profesionalmente al ámbito de los servicios de las tecnologías de la información y que culmina este año 2018 con su Jubilación.

Queremos aprovechar esta fecha tan significativa, para hacerle una pequeña entrevista que compartir con todos vosotros.

¿Cómo ha evolucionado la labor de programación hasta la actualidad, que aspectos son los que más han cambiado?

Vaya por delante que ¡¡¡me encanta programar!!! Me ha gustado siempre y cuando mis responsabilidades profesionales ya no lo contemplaban, de una u otra forma he encontrado momentos en los que hacerlo.

Respondiendo a tu pregunta, veo tres razones (seguro que hay cien mil…) que desde mi punto de vista han hecho evolucionar el concepto "programación":

La velocidad y capacidad de los sistemas han permitido dejar en un segundo plano el concepto de "peso del sw" y lamentablemente en muchos casos también el de "optimización del sw".

La "humanización" de los lenguajes de programación y su oferta de componentes ya construidos, evita al desarrollador el manejo de código numérico o pseudo-numérico, y la reinvención continua de la rueda.

Y finalmente, el cambio de prioridad “anteponiendo el usuario por delante de la funcionalidad”, ha modificado el concepto de programación. Ya no es el usuario quien debe adaptarse, sino el software el que deberá satisfacer sus necesidades, contemplando conceptos tales como usabilidad, diseño, maquetación, …

¿Qué aspectos serían los más destacados, en las buenas prácticas en las Tecnologías de la Información?


Aunque comúnmente las mejores prácticas en TI se identifican con la arquitectura empresarial, la gestión de servicios, la gestión de riesgos, la gestión de seguridad de la información y la gobernanza; desde mi enfoque cercano a la Calidad y los Recursos Humanos destacaría la importancia del concepto “Mejora Continua” dentro de la organización: la búsqueda permanente de la optimización de procesos y metodologías, que permita seguir siendo competitivo en un entorno cada vez más exigente y con menores márgenes de maniobra.

Y esto solo se consigue con la implicación y convencimiento de toda la plantilla y con el impulso y respaldo firme desde la propia dirección.

¿Qué importancia tienen las certificaciones de calidad, en las organizaciones y en el proceso productivo del desarrollo software? 

Al hilo de la pregunta anterior, la forma de institucionalizar la mejora en una Organización debe basarse en estándares de calidad, que garanticen un observatorio permanente de nuevas tendencias y que permitan mantener actualizadas las prácticas asumidas dentro de los procesos productivos.

La tecnología evoluciona constantemente y las metodologías deben ser capaces de adaptar procesos y procedimientos a las nuevas formas de trabajo.

El crecimiento del negocio de las empresas en Euskadi, igual que a nivel global, ha pasado de lo local a lo internacional. ¿Que reseñarías en este aspecto?, ¿es muy costosa la evolución que ha implicado el nuevo mercado?. ¿En qué se diferencia, en cuanto a las capacidades que demandan a nivel Europeo de las empresas? 

Además de la “globalización” como concepto básico dentro de cualquier planteamiento, la internacionalización implica nuevos retos dentro de la comunicación y composición de equipos de trabajo con ubicaciones, horarios y entornos diferentes.

Las empresas deben evolucionar para ser capaces de proporcionar equipos multidisciplinares que trabajen en un mismo proyecto desde ubicaciones distintas, que soporten el teletrabajo y la implicación directa y continua del cliente en los propios desarrollos.

Para finalizar, a tu juicio, ¿cuáles son los principales desafíos y evolución a los que se enfrentan las empresas TIC en los próximos años?

Aunque suene raro, el gran desafío al que el sector se enfrenta no es tecnológico, o al menos no solo tecnológico.

La recuperación económica dentro del sector TIC está seriamente comprometida por la dificultad de encontrar profesionales que permitan hacer frente a la gran demanda prevista de aquí al horizonte 2020.

El GAP entre la oferta de profesionales y la demanda estimada es capaz de frenar considerablemente el crecimiento de todo el mercado europeo.

Las carreras tecnológicas han perdido “tirón” dentro de las preferencias que los jóvenes actuales contemplan a la hora de elegir sus trayectorias profesionales y si el sector no es capaz de volver a ilusionarles, vamos a tener (ya lo estamos teniendo), un gran problema.

Luis, muchas gracias por compartir tu visión con todos nosotros.

'El principal factor de riesgo para tener cáncer es vivir' Ander Urrutikoetxea - Onkologikoa


Hoy recogemos la entrevista realizada en 'Boulevard Magazine' a Ander Urrutikoetxea, director de Onkologikoa, que participa junto a Bilbomática en el consorcio Internacional del proyecto Desiree para la mejora del estudio y tratamiento de cáncer de mama.

Ander Urrutikoetxea responde sobre los últimos avances en la lucha contra el cáncer, especialmente del test líquido y de la inmunoterapia.



"El cáncer es, sin duda, una de las enfermedades más temidas. Pero los datos demuestras que actualmente: la mitad de los casos se curan. Los avances científicos permiten que la detección sea cada vez más temprana, y unido a eso las nuevas terapias permiten superar casos que hasta ahora  se daban por perdidos. Las últimas semanas, por ejemplo se ha hablado mucho del test líquido, de un análisis de sangre que permite detectar hasta 8 casos de cáncer..."

"...En este momento es la segunda causa de muerte en el mundo y el año pasado, por primera vez, fue la primera causa de muerte en Euskadi. Hablamos de todo ello con el oncólogo Ander Urrutikoetxea, director científico del Onkologikoa de Donostia..."

Noticia: Radio Euskadi DIA DEL CÁNCER 'El principal factor de riesgo para tener cáncer es vivir'


10/26/2017

Basque Medical Devices Capacities Directory - Bilbomática

Hoy recogemos la presentación del "Basque Medical Devices Capacities Directory", donde Bilbomática muestra su "expertise" Socio-Sanitario en los ámbitos de Monitoring devices, co-development Medical image  analysis software, diagnostic nuclear image system (pet, spect, mri ), information systems for healthcare providers, mobile health, Interoperability, telehealth, dss (decisión support system) y Bigdata.







"Medical Devices and Digital Health sectors are multidisciplinary areas that need, for their development, many different capabilities and a high level of knowledge and expertise in diverse disciplines, as well as the convergence of appropriate resources in an environment able to foster innovation.

Indeed, Medical Devices and Digital Health sectors cannot prosper without an appropriate ecosystem in which biomedical and health sciences meet technologies such as Electronics, Mechatronics, ICTs (Information and Communication Technologies) or Advanced Manufacturing, among others. The sector is extremely demanding of innovative high technology, that needs close collaboration among industry, technology platforms, R&D centers and Healthcare centers.

In this context, the Basque Country presents an attractive scenario with great potential for the development of the Medical Devices and Digital Health sectors, due to the following strengths:

• A strong regional specialization and promotion of Biosciences and Health, merging industry, scientific and technological agents and clinical centers.

• Powerful and highly competitive capabilities in Advanced Manufacturing, as a result of the transfer of innovations in technologies such as nanotechnology or ICTs to the traditional industrial sectors.

• A dynamic and strong ICT and Electronic sector with multiple links with Health and Biosciences.

• A highly integrated network of Healthcare providers, able to give a powerful traction to multiple developments related to biomedicine, e-health or medical devices.

• A dense network of scientific and technological centers with top-level capabilities in areas connected with Medical Devices and Digital Health, and with a culture of innovation and collaboration with industry.

• A high and sustained commitment of the Regional Government with innovation, that has led to the creation of a strongly effective ecosystem of innovation that provides support and resources and facilitates collaboration among private and public entities and among agents through the whole innovation value chain"

Link BASQUE MEDICAL DEVICES CAPACITIES DIRECTORY

10/19/2017

Cáncer de mama hereditario - Sistemas Genómicos Ascires


Esta extraña radiografía tomada por Rosalind Franklin en 1952, permitió a  Watson y Crick confirmar la estructura de doble hélice, modelo del ADN.
Rosalind Frankllin, durante la Segunda Guerra Mundial, se graduó en Física y Química por Cambridge. Posteriormente en París, aprendería la técnica de difracción de Rayos X, que utilizara en sus trabajos de investigación sobre el ADN en el prestigioso King’s College, donde obtuvo la famosa radiografía conocida como la fotografía 51.
En 1962 el Premio Nobel de Medicina recayó sobre Francis Crick, James Watson y Maurice Wilkins, por sus descubrimientos acerca de la estructura molecular de los ácidos nucleicos y su importancia para la transferencia de información en la materia viva, siendo  la gran olvidada en este galardón Rosalind Franklin, que hoy en día es considerada una de las mujeres más influyentes de la ciencia.


Tras este pequeño reconocimiento a la gran investigadora Rosalind Frankin, damos un gran salto temporal en los avances en Genomica, gracias a la Dra. Sonia Santillán Garzón, Directora Médica de Sistemas Genómicos grupo Ascires , empresa dedicada a la investigación de códigos genéticos de ADN y ARN, que participa junto a Bilbomática, en el proyecto Desiree (Decision Support and Information Management System for Breast Cancer), iniciativa internacional para la mejora del estudio y tratamiento del cáncer de mama en el marco de los proyectos de Investigación Europeos H2020.

¿Sonia, como destacarías la importancia de la genética hoy en día, en los proyectos de investigación clínica ?

La Genética Médica se encuentra relacionada con todas las especialidades médicas descritas.
A esta fecha, se han descrito más de 7000 enfermedades genéticas que son evaluadas por diferentes especialidades médicas.
La aplicación de la genética en los proyectos de investigación parte de que el diagnóstico de una enfermedad esté confirmado desde el punto de vista genético, para que a partir de esta información, se puede establecer modelos de pronóstico, riesgo familiar y en este nuevo tiempo, conocer las rutas que se encuentran implicadas en la enfermedad y la posibilidad de terapia dirigida o de nuevas metodologías de reparación de ADN como CRISPR9.

Entrando en el proyecto DESIREE, en el que Sistemas Genómicos trabaja en el ámbito de estratificación de las pacientes de cáncer de mama hereditario, ¿ Qué población de mujeres con cáncer de mama, se ve afectada ?

El proyecto DESIREE, se inicia con la toma de datos  dirigido a sospechar si el cáncer de mama detectado puede ser de tipo familiar.  Si la primera fase, revela una información de alto riesgo, el árbol de decisiones llevará a la consulta especializada de Genética Médica.
El cáncer de mama es el más frecuente en mujeres. Hasta un 10%  de los cánceres de mama y ovario son debidos a mutaciones germinales en genes de susceptibilidad, algunos ya identificados como genes de alta penetrancia como BRCA1 y BRCA2 y otros en constante investigación.
Las variantes patogénicas identificadas en los  genes BRCA1 y BRCA2 se heredan por un modelo monogénico autosómico dominante, con un riesgo de transmisión a la descendencia del 50%, por lo que su detección temprana  permitirá la inclusión de estas personas en riesgo en programas de detección precoz.

El proyecto DESIREE, ofrece una plataforma para la ayuda a la toma de decisión, en las unidades funcionales de cáncer de mama,  ¿ Qué aporta a nivel de servicios, Sistemas genómicos a estos profesionales ?

Sistemas Genómicos grupo Ascires aporta toda la estructura  de Genética Médica  aplicando su modelo de valoración clínico-genético y árbol genealógico normalizado de al menos tres generaciones, para la detección de riesgo elevado de cáncer de mama y ovario, agregación familiar o cáncer múltiple.
Según los resultados obtenidos en la fase clínica, se indican los estudios moleculares de los genes implicados, cuyos resultados se integrarán a la base de datos dbnlvar.

¿Qué  tipos de Análisis genéticos, vais a llevar a cabo a las pacientes que participan en el proyecto. ?


Según la historia familiar, sólo cuando las pacientes presenten un riesgo alto de presentar un cáncer de mama de carácter hereditario, se inicia con la secuenciación masiva de una selección de genes contenidos en el panel Oncogeneprofile v.3, desarrollado en un proyecto colaborativo con el Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas y Sistemas Genómicos y certificado con marcado CE por la Agencia Española del Medicamento para uso en diagnóstico molecular.

El análisis biomédico se empieza con la detección de mutaciones de los genes BRCA1 y BRCA2 mediante la aplicación de diferentes herramientas bioinformáticas y bases de datos que permitan una interpretación actualizada de las variantes encontradas. Posteriormente se realiza la confirmación por secuenciación Sanger de las variantes patogénicas detectadas y se transcribe el informe personalizado.

¿Qué otros genes, aparte de BRCA1 y BRAC2 se encuentran actualmente en el ámbito de la investigación, para la detección del cáncer hereditario ?

La investigación en el cáncer familiar tiene una elevada producción científica, tanto que en estos últimos años se encuentra en más de 2000 artículos por año.
Por ello, la traslación de estos datos al ámbito diagnóstico es incesante en la búsqueda, especialmente de nuevas opciones terapéuticas como es el uso de Olaparib en el tratamiento del Cáncer de Ovario de mujeres portadoras de una mutación en los genes BRCA1 o BRCA2.


Agradecer a Dra. Sonia Santillán Garzón, Directora Médica de Sistemas Genómicos grupo Ascires  por compartir su experiencia.


Fuentes:
Imagen Foto 51

http://scarc.library.oregonstate.edu/coll/pauling/dna/pictures/sci9.001.5-large.html

http://www.elconfidencial.com/tecnologia/2014-03-13/las-diez-mujeres-mas-influyentes-de-la-ciencia-de-marie-curie-a-hipatia_101069/

http://blogthinkbig.com/fotografia-51/

http://www.muyinteresante.es/ciencia/preguntas-respuestas/que-es-la-famosa-fotografia-51-961440497430

https://es.wikipedia.org/wiki/Fotograf%C3%ADa_51

http://www.muyinteresante.es/salud/articulo/rosalind-franklin-la-fotografia-que-probo-la-estructura-del-adn-511374751470

10/18/2017

Sistema de gestión integrado para la monitorización de la infección nosocomial - FOCUS

Bilbomática, se encuentra analizando las posibilidades de evolución y su adecuación tecnológica del sistema de gestión integrado para la monitorización de la infección nosocomial - FOCUS, este sistema que nos ha permitido adquirir expertis en el  ámbito de las interoperabilidad  entre los sistemas de Resultados de Microbiología, CMBD, Registros de Anatomía Patológica, Unidosis: utilización de antibióticos y enfermería.

Las capacidades del sistema se centran en :

- Realizar "estudios de prevalencia" en tiempo real.
- Detectar problemas en pacientes que permita anticiparse en la toma de decisiones clinicas.
- Facilitar el seguimiento multidisciplinar de pacientes con infecciones graves.
- Detectar brotes.
- Sistema de alarmas configurables por el Hospital ( Avisos de multiresistentes, envío a la unidad de enfermeria de las medidas de asilamiento, EDOs, etc )
- Consumo de antibióticos restringidos.




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Integrated Management System For Monitorization Of Nosocomial Infection

On the one hand it performs a general analysis of nosocomial infections, getting to know this way the effect of the said infection, and on the other hand it generates alarms which notify the relevant staff so that they can proceed to take the necessary actions.

10/17/2017

Cáncer de mama en Euskadi, a la vanguardia de la investigación


Tras haber alcanzado el ecuador del proyecto de investigación Desiree (Decision Support and Information ManagementSystem for Breast Cancer) y coincidiendo con la revisión del mismo por la Comisión Europea.


Disponemos de las primeras versiones, del sistema de información mas avanzado, a nivel internacional. Posicionando a Euskadi a la vanguardia de la investigación, en el cáncer de mama en el ámbito de las tecnologías de la información.

Centrados en los desarrollos de Bilbomática (Bizkaia), para el manejo de la información heterogénea de las unidades funcionales de mama y donde Fundación Onkologikoa (Gipuzkoa) cuenta con un papel destacado en el ámbito clínico. Se complementa con el líder del proyecto Vicomtech-IK4 (Gipuzkoa), con los Sistemas Avanzados de Soporte a la Decisión.

Para alcanzar el presente grado de avances a nivel internacional, el consorcio se complementa con las aportaciones de nuestros socios:


- Desde la Comunidad Valencia con Eresa y Sistemas Genómicos.

- A nivel Europeo, desde Francia con los hospitales de Saint-Louis y George Pompidou pertenecientes a  al Assistance Publique-Hôpitaux de Paris (AP-HP) y también el centro de investigación INSERM-LIMICS.

- Las empresas Medical Innovation and Technology de Grecia, Arivis AG de Alemania y la Universidad del Ulster de Reino Unido.

Ademas de forma significativa la cooperación internacional se ve reforzada, por la participación de Houston Methodist Research Institute de Estados Unidos, centro de referencia en el cáncer.


A provechando el próximo Día Internacional del Cáncer de Mama (Jueves 19 Octubre), recogemos la rueda de prensa, donde la doctora de Onkologikoa, María Jesús Michelena compareció junto a ella, el consejero de Salud, Jon Darpón, la diputada de Políticas Sociales de Gipuzkoa, Maite Peña, y Txaro Beobide, presidenta de la asociación Katxalin:

"En Euskadi se detectan cada año 1.450 nuevos casos de esta enfermedad. Esta patología se ha incremento en el periodo 2000-2015 a razón de un 1,5% anual."

"Sobre las causas de esta tendencia ascendente ha apuntado al envejecimiento de la población, el estilo de vida, la obesidad, la ausencia de ejercicio físico o factores hereditarios así como al uso de la mamografía que ha permitido diagnosticar más casos cuando son asintomáticos, ha explicado."

"Los datos del Registro de Cáncer sobre la evolución de la supervivencia reflejan que se ha pasado del 83,4% (periodo 2000-2004) al 86% en 2010-2012. Los últimos estudios la sitúan incluso por encima del 90% cuando la enfermedad es detectada en su fase inicial. "



A continuación os dejamos algunas referencias a la noticia:

El Mundo - Pais Vasco 
Deia
eitb.eus

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European UnioneHealth

Este proyecto ha recibido fondos de la Unión Europea en el marco del programa de investigación e innovación Horizon 2020 con el número de acuerdo de subvención 690238

 Los autores quieren agradecer el conocimiento y las contribuciones de los miembros del consorcio.
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9/15/2017

Guipúzcoa en tus ojos - #APOYODRAVET

Ha dado comienzo la campaña de crowdfunding-matchfunding del proyecto de Apoyodravet “Guipúzcoa en tus ojos”, un fascinante proyecto, que pretende conseguir un ocio y tiempo libre inclusivo para todas las personas independientemente de su condición. Y lo queremos conseguir, ayudándonos de realidad virtual, realidad aumentada y vídeos 360º.

Personas que no pueden acercarse a nuestros lugares, los conocerán de la mano de este programa tecnológico inclusivo.

Ayúdanos a hacerlo realidad¡¡¡




Programa tecnológico inclusivo, que acerca los lugares turísticos y culturales mediante realidad virtual, realidad aumentada y videos 360º a personas con discapacidad.